作物遗传育种学科为安徽省重点学科，隶属于作物学一级学科。该学科形成较为完备的科研队伍和研究平台，具有固定科研人员23人，其中具有高级职称的18人，中级职称5人，具有博士学位的有17人，占总人数的74%，具有海外留学经历的有7人，师资队伍老中青结合，结构较为合理。目前，该学科拥有作物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室、农业部小麦生物学与遗传育种重点实验室、农业部小麦区域创新中心、农业部弱筋小麦原原种繁育基地等科研平台，仪器设备总价值超过2000余万元，形成较为完备的科研平台。

近年来，该学科先后承担国家科技支撑计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金、省部级重大科研项目20多项，总经费达3000余万元，有力地推动该学科的快速发展。先后审定小麦、玉米、水稻、棉花、油菜等主要农作物新品种十多个，近五年累计推广面积超过1000万亩，产生较好的经济效益和社会效益。发表学术论文200多篇，其中50余篇被SCI期刊收录。获得省部级科研奖项3项、申请/获得国家发明专利10余项。在人才培养方面，近五年来，先后培养硕士研究生200多名、博士生30余名、本科生500余名，达到了学科人才培养的目标。